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大家好,这里是沐籽李 一个专注于在分享中提升自我的药学生◕‿-。 日常干货输出,关注不迷路! 想必各位科研er都了解文章作图的重要性,一张美观的图片能够瞬间抓住审稿人的眼球,大大增加文章发表的机会。作为药学方向的搬砖人,我们最常遇到的就是绘制蛋白-配体相互作用,或是蛋白-蛋白相互作用图啦。这时候就需要搬出分子可视化工具Pymol来帮助我们解决问题了!
部分pymol展示方式
Pymol是一款基于python的分子可视化软件,在正式安装前,需要配置python环境,在此基础上我们才能安装Pymol。
Python
配置 1. 下载与安装 1.1打开python官网,点击DOWNLOD下的WIindows,选择python版本,并下载安装包。 1.2 双击安装包开始安装,一路NEXT直到Finish。
2. 配置环境变量 2.1 找到安装python的文件夹,即上文的安装路径,复制红框里的内容。
2.2 进入“我的电脑”,空白处右键选择“属性”。选择红框里的“高级系统设置”。
2.3 按下图照箭头的指示,先点击“系统属性”中的“环境变量”;然后在“环境变量”中找到“Path”,点击下面的编辑;点击新建,粘贴刚刚复制的路径。
2.4 可以通过以下的方法来验证是否安装成功:同时按住小窗户键+R键,在弹出的窗口中输入cmd并回车,在弹出的黑框界面输入:python -V。如果出现了python版本即安装成功!
Pymol
安装 1. 下载与安装 1.1 进入pymol官网(https://pymol.org/2/),点击DOWMLOAD,下载Windows版本。
1.2 双击软件进行安装,一路next,选择安装路径,注意安装路径需要全英文,不要含有中文。
1.3 点击install安装。
1.4 点击finish完成安装。
2. 获取license 2.1 双击快捷方式,打开软件。提示我们需要license才能长期使用。
2.2 获取方式 通过学号邮箱申请license 后台回复“Pymol安装”即可领取license
2.3 选择license所在路径,弹出下面的窗口即成功了。
以上就是本期的全部内容啦 对安装还有疑问的小伙伴 后台回复“发现沐籽”就能找到我哦~ 后期沐籽还会继续分享 Pymol实用作图技巧 关注沐籽不迷路!! -END-
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